3x09 - Doom Gemisi

Gösteri, Scarship adlı devasa bir Metarex ve daha küçük gemilerden oluşan bir donanmanın yer aldığı bir dövüşle başlar. Scarship her gemiyi yok eder ve yeni bir göreve atanır: Sonic ve Dr. Eggmanı yok etmek. Blue Typhoonun içinde herkes Shadowun dönüşü hakkında sorular sorar. Yumurta Taşıyıcıda, Dr. Eggman Scarshipin yaklaşmakta olduğunu ve savaşın devreye girdiğini öğrenir. Eggman, Scarshipi yok etmesi için Shadowu gönderir, ancak Shadow bu işi yapamaz. Rouge, Starship bir füze göndermeden hemen önce Yumurta Taşıyıcısından kaçar ve onu yok etmiş gibi görünür. Rouge, Blue Typhoonun mürettebatını durum hakkında bilgilendirir ve onlara savaştan görüntüler gönderir. Cosmo Scarshipi tanır, grubun gemisini yok eden Metarextir. Cosmo, arkadaşının hayatını riske atmak istemediği için Tailse kaçması için yalvarır. Ancak Sonic ve diğerleri, Scarship ile yüzleşmeleri gerektiği konusunda ısrar ediyorlar. Savaş başlar ve kimse avantaj sağlayamaz. Ancak Sonic, Amy ve Knuckles gemiyi fark edilmeden terk ederler ve Scarshipin silahlarını engellemenin bir yolunu bulurlar. Scarship, Blue Typhoona çarparak onu yok etmeye karar verir. Tayfun zamanında yolundan çıkamayacak, ancak Gölge birden ortaya çıkıyor ve Scarshipi elinden alıyor. Eggmanın Scarshipten kaçabildiği anlaşılıyor. Sonic ve Shadow Scarshipin içine girerler ve makine dairesini yok ederler. Ancak, Scarship asla teslim olmayacak ve kendi kendini yok etmek üzere. Shadow, etrafındaki zamanı dondurabilir ve Sonic, Power Cannon ile onu yener.